四平衛(wèi)校為副縣級事業(yè)單位，隸屬市衛(wèi)生局管轄。學(xué)校下設(shè)25個處室（學(xué)科），黨委下設(shè)6個黨支部，具體如下：
一、處室（學(xué)科）
學(xué)校辦公室 黨委辦公室 學(xué)生處 教務(wù)處 督學(xué)辦
護(hù)理學(xué)科 藥學(xué)學(xué)科 臨床醫(yī)學(xué)學(xué)科 醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)學(xué)科 文化基礎(chǔ)學(xué)科
實(shí)驗(yàn)管理中心 剖檢中心 現(xiàn)代教育技術(shù)中心 科研辦 圖書館
招生辦公室 實(shí)訓(xùn)就業(yè)辦公室 聯(lián)合辦學(xué)辦公室 人事處 財務(wù)處
工會 團(tuán)委 審統(tǒng)辦 保衛(wèi)處 總務(wù)處
二、黨支部
教管黨支部 教輔黨支部 專業(yè)課黨支部 基礎(chǔ)課黨支部 機(jī)關(guān)黨支部
總務(wù)黨支部 老干部黨支部